C (Chunting) Lang: Translational genomics from model species Medicago truncatula to crop legume Trifolium pratense

  Nieuws
  Vaknieuws
  Wagenings commentaar
  Dossiers
  Perskamer
  Archief
  Agenda
  2012
  2011
  2010
  2009
  2008
  2007
  2006
  2005
  2004
  2003
  2002
  2001
  2000
  1999
  Nieuws
  RSS
  Agenda
  Open dagen
  Congressen en symposia
  Cursussen
  Promoties & Oraties

31 jan 2012 16:00
Locatie: Aula, gebouw 362, Gen. Foulkesweg 1, Wageningen
Promotor: prof.dr. A.H.J. Bisseling (Moleculaire biologie mbav de ontwikkelingsbiologie van planten)
Co-Promotor: dr. ir. R. Geurts

De vlinderbloemige plantensoort Rode klaver groeit niet alleen als ‘onkruid’ in de wegberm, maar is ook een belangrijk voedergewas voor herkauwers. Bij koeien en schapen kan een dieet op basis van Rode Klaver de melkproductie bevorderen. Daarnaast bevat de plant stoffen, met name isoflavonen,die een positieve uitwerking hebben op de gezondheid van de mens. Dit maakt Rode klaver een interessant gewas. In dit project is de opmaak van het Rode klavergenoom vergeleken met een vlinderbloemigemodelplant; te weten Medicago truncatula (ook wel Medicago genoemd).Van deze modelplant is het genoom (het DNA) volledig ontrafeld; dit in tegenstelling tot Rode klaver. Medicago en Rode klaver zijn nauwverwant. Om de vergelijking mogelijk te maken is de structuur vanhet Rode klavergenoom in kaart gebracht en vervolgens vergeleken metde genoomsequentie van Medicago. Deze vergelijking heeft laten zien dat er zeer veel veranderingen hebben plaatsgevonden tussen beide genomen. Er zijn zelfs veel meer veranderingen opgetreden dan je op basis van verwantschap zou kunnen verwachten. Een verdere analyseheeft vervolgens aangetoond dat deze veranderingen alleen voorkomen in Rode klaver en niet in verwante klaversoorten; bijvoorbeeld Witte klaver. Ook is er een DNA-element gevonden dat honderden keren voorkomt in het Rode Klaver genoom, maar niet in andere Klaversoorten. Dit DNA-element zit precies op die plekken in het DNA waar de veranderingen t.o.v. Medicago zijn gebeurd. Daarom voorspellen wij dat dit DNA-element mede de oorzaak is van de genoomre-shuffling zoals opgetreden in Rode klaver.
Print dit agenda item