瓦赫宁根研究机构
受政府、商业机构和非营利组织等的委托，瓦赫宁根大学及研究中心旗下的研究机构主要进行应用研究，课题涵盖多学科与多领域。
瓦赫宁根大学生物兽医研究院(Wageningen Bioveterinary Research)
瓦赫宁根生物兽医研究员是瓦赫宁根大学及研究中心的一份子，专注于顶级的兽医学研究，维护动物和人类的健康。
农业经济研究院 (Wageningen Economic Research)
瓦赫宁根大学及研究中心农业经济研究所是一个独立的、世界一流的社会经济学研究机构。它独有的数据、模型和专业知识，以及创新的研究方法，在政策或决策制定过程中可以给合作方提供专业综合的咨询与建议，促进实现更加可持续发展的世界。
环境科学研究院 (Wageningen Environmental Research)
WERN 致力于通过高水平的独立研究，实现高品质和可持续绿色居住环境。
食品与生物基研究院 (Wageningen Food & Biobased Research)
围绕健康食品、新鲜食品链、生物精炼、生物基化学和材料学等课题，研发可持续的、创新的、以市场需求为导向的解决方案。
畜牧科学研究院(Wageningen Livestock Research)
围绕可持续盈利的畜牧养殖进行基础的、创新的研究，并提出切实可行的解决方案。
海洋科学研究院(Wageningen Marine Research)
战略型和应用型海洋生态环境研究。
植物科学研究院(Wageningen Plant Research)
开发植物身上蕴含的各种潜力，帮助解决食品、原材料和能源相关的社会问题，我们的宗旨：植物改变生活。
瓦赫宁根食品安全研究院(Wageningen Food Safety Research)
WFSR主要进行安全可靠的食品安全研究，我们的专长在于进行（法证层面的）检测和最高水平的食品安全研究，并且24/7随时准备应对突发食品安全事件。