Innovaties in gewascollectie management

Project

Innovaties in gewascollectie management

De omgeving waarin het CGN haar collecties beheerd is aan constante veranderingen onderhevig. Met name de maatschappelijke en wetenschappelijke ontwikkelingen vragen om, en bieden nieuwe mogelijkheden voor, permanente aanpassingen van de methoden waarmee genetische diversiteit ex situ in stand wordt gehouden en beschikbaar wordt gemaakt. Deze hebben betrekking op de vorming van nieuwe type collecties, kennis opbouw en communicatie over de collecties, en veranderingen ten gevolge van wettelijke ontwikkelingen.

Het CGN zal haar rol als vernieuwende genenbank verder uitbouwen en zo beter inspelen op de veranderende behoeften van het bedrijfsleven, de wetenschap en de maatschappij.

(1) Er zal meer worden ingespeeld op de behoefte vanuit de gebruikers aan andere type collecties, niet primair gericht op conservering, zoals onderzoekspopulaties voor kartering, homogene lijnen voor genotypering en fenotypering, maar ook collecties gericht op gebruik in het onderwijs en publieksvoorlichting. (2) De documentatie van de collecties van het CGN, en de beschikbaarstelling van de betreffende informatie aan gebruikers, zal worden onderhouden en waar mogelijk verbeterd. (3) Er zal actief en op groter schaal om feed-back van verschillende gebruikersgroepen op de inrichting van de CGN website worden gevraagd. Op basis hiervan zullen de CGN sites worden aangepast of vernieuwd. (4) Er zal, i.s.m. lopende initiatieven zoals DivSeek (initiatief Global Crop Diversity Trust e.a.) en het Virtual Lab for Plant Breeding (publiek/privaat initiatief), een prominente rol worden gespeeld in het zoeken naar en toepassen van benaderingen die de gebruikers van genenbanken optimaal in staat zullen stellen gebruik te maken van de kennis en data gegenereerd door de genomica en deze te combineren met traditionele phenotypische informatie. (5) Er zal aan de voorwaarden worden voldaan om in het kader van de Europese implementatie van het Nagoya protocol de CGN collecties de status van ‘Registered Collection’ te laten krijgen. (6) Tevens zal een systeem worden ingevoerd waarmee tegen minimale transactiekosten een handling fee van de gebruikers van de CGN collecties kan worden gevraagd, met het oog op het terugdringen van ongewenst gebruik. (7) Tenslotte zal de kennis over de CGN collecties verder worden uitgebouwd door een voortzetting van de pre-competitieve evaluatie programma’s i.s.m. met het veredelingsbedrijfsleven en Plantum, die waar mogelijk zullen worden uitgebreid met genotypering van de CGN collecties, evt. via TKI initiatieven.

Resultaten en Producten 2016

-      Het ‘special collection’ concept is verder uitgewerkt en uitgedragen, en toegepast in de bestaande collectie van gesequencete tomatenlijnen en uitgebreid met een collectie SSD sla lijnen die eveneens gesequenced worden.

-      De websites onder beheer van het CGN-PGR zijn onderhouden en stapsgewijs verbeterd. De gewas portalen (aardappel en sla ) zijn verder aangepast op basis van feedback van gebruikers.

-      Het hoge kwaliteitsniveau van de documentatie van de CGN collecties, in het systeem Genis (data en applicatie) en de gewasportalen, is gehandhaafd. Ook zijn er belangrijke bijdragen geleverd aan de internationale coördinatie via EURISCO, Genesys en het Global Information System van de IT-PGRFA.

-      De mogelijkheden om CGN collecties te doorzoeken op basis van Next Generation Sequencing data zijn verder ontwikkeld door actieve deelname aan internationale (DivSeek) initiatieven en door samenwerking binnen WPR (Plantenveredeling).

-      Er zijn fenotypische gegevens verzameld, in samenwerking met het Nederlandse veredelingsbedrijfsleven over met name prei sla en spinazie. Ook is, in het kader van een TKI project, het sla materiaal (500 CGN accessies) geselecteerd, gezaaid, bemonsterd en de SSD zaden geoogst.

Hoofd-editorschap van het wetenschappelijke tijdschrift ‘Plant Genetic Resources: Charaterisation and Use’, uitgegeven door Cambridge University Press.

Publicaties