Project

Validatie Synchytrium PRC Euphresco

TaqMan PCR test voor Synchytrium endobioticum en een TaqMan PCR test voor het onderscheid tussen Fysio-1 en andere fysio’s.

Doelstellingen project

Het doel van het project is tweeledig:

  1. Validatie TaqMan PCR test voor Synchytrium endobioticum en een TaqMan PCR test voor het onderscheid tussen Fysio-1 en andere fysio’s in Euphresco verband middels uitvoering van een training/workshop en een ringtest; PRI ondersteunt NVWA.
  2. Sequentie analyse van DNA en RNA preparaten van meerdere isolaten van Fysio-1 om zodoende de huidige toets verder te ondersteunen met gen-gerelateerde merkers.

Aanpak en tijdspad

  • Er wordt door NVWA een workshop/training/ringtest Fysio-1 test wratziekte opgezet en uitgevoerd met ondersteuning vanuit PRI.
  • PRI voert sequentie analyse uit van:
    • Een DNA preparaat van één Fysio-1 isolaat (MB42) m.b.v. Pacific Bioscience platform en sequentie analyse.
    • Een aantal RNA preparaten van Fysio-1 isolaat (MB42) m.b.v. Ilumina HiSeq platform en sequentie analyse.

Resultaten

  • Verzameling materiaal, DNA extractie, RNA extractie-protocol, RNA extracties, Aanvullende DNA en RNA sequenties van één Fysio-1 isolaat (MB42)
  • Eindverslag
Binnen dit project verkregen sequenties zijn beschikbaar voor projectpartners (inclusief de 9 á 10 partners in het Euphresco-SENDO project)