Project
Validatie Synchytrium PRC Euphresco
TaqMan PCR test voor Synchytrium endobioticum en een TaqMan PCR test voor het onderscheid tussen Fysio-1 en andere fysio’s.
Doelstellingen project
Het doel van het project is tweeledig:
- Validatie TaqMan PCR test voor Synchytrium endobioticum en een TaqMan PCR test voor het onderscheid tussen Fysio-1 en andere fysio’s in Euphresco verband middels uitvoering van een training/workshop en een ringtest; PRI ondersteunt NVWA.
- Sequentie analyse van DNA en RNA preparaten van meerdere isolaten van Fysio-1 om zodoende de huidige toets verder te ondersteunen met gen-gerelateerde merkers.
Aanpak en tijdspad
- Er wordt door NVWA een workshop/training/ringtest Fysio-1 test wratziekte opgezet en uitgevoerd met ondersteuning vanuit PRI.
- PRI voert sequentie analyse uit van:
- Een DNA preparaat van één Fysio-1 isolaat (MB42) m.b.v. Pacific Bioscience platform en sequentie analyse.
- Een aantal RNA preparaten van Fysio-1 isolaat (MB42) m.b.v. Ilumina HiSeq platform en sequentie analyse.
Resultaten
- Verzameling materiaal, DNA extractie, RNA extractie-protocol, RNA extracties, Aanvullende DNA en RNA sequenties van één Fysio-1 isolaat (MB42)
- Eindverslag