Het verkennen van Microbiële Immuniteit voor CRISPR-tools op Maat voor Genoomtechniek in Planten

Samenvatting

CRISPR-Cas is de basis van een biotechnologische techniek waarbij kleine aanpassingen aan het genoom van levende organismen nauwkeurig gemaakt kunnen worden. Hoewel deze methode veel heeft betekend voor de plantenwetenschappen, werkt het in planten vaak minder efficiënt. De technologie is gebaseerd op enzymen die oorspronkelijk in bacteriën ontstonden als verdediging tegen virussen. De meest gebruikte enzymen komen echter allemaal uit bacteriën die leven in zoogdieren, en zijn daardoor geoptimaliseerd voor hogere temperaturen dan die waarin planten meestal groeien. In dit onderzoek hebben we gezocht naar alternatieve CRISPR-Cas enzymen uit bacteriën die voorkomen in de bodem of in de nabijheid van planten. We ontwikkelden een methode om deze enzymen te identificeren in grote DNA-datasets en testten hun toepasbaarheid in planten. Daarbij introduceerden we meerdere nieuwe tools. Hoewel deze enzymen afkomstig zijn van plant-geassocieerde bacteriën, blijken ze helaas geen verbetering te bieden ten opzichte van de bestaande enzymen.