Promotie
Horizontaal Dansende Bacteriën en Andere Pogingen tot Verbetering in het Gebruik van CRISPR-Cas voor Genetische Aanpassingen
Samenvatting
Bacteriën worden continu bedreigd door DNA en RNA moleculen die proberen binnen te dringen, bijvoorbeeld afkomstig van virussen. Om zich te beschermen hebben bacteriën een scala aan verdedigingsmechanismen. Eén daarvan, CRISPR-Cas, gebruikt RNA moleculen om CRISPR-geassocieerde (Cas) eiwitten te leiden naar het binnengedrongen DNA of RNA. Het Cas eiwit belemmert de indringer vervolgens, bijvoorbeeld door diens DNA te knippen. Wij kunnen dit mechanisme gebruiken om het DNA aan te passen van vele levensvormen zoals dat van planten, van gist, en van onszelf. Deze manier om het genoom te bewerken is nauwkeurig en efficiënt gebleken, maar voor sommige toepassingen is er nog ruimte voor verbetering. Daartoe kunnen nieuwe Cas eiwitten in kaart worden gebracht, kunnen al bekende Cas eiwitten worden aangepast, en kunnen nieuwe methoden worden gebruikt voor genomische aanpassingen. Dit proefschrift behandelt een aantal van deze benadering voor het uitbreiden van de mogelijkheden tot genomische aanpassingen, op basis van CRISPR-Cas.