Project
Sequencing AI isolaten bij zoogdieren
Het doel van dit project is de volledige genoomsequenties van vogelgriepvirussen uit zoogdieren (wilde fauna) te bepalen. Vervolgens worden fylogenetische analyses uitgevoerd om de verwantschap met wilde vogelvirussen te analyseren, en volgt een genetische analyse om het ontstaan van zoönotische mutaties in kaart te brengen.
Tijdens de vogelgriep uitbraak in 2021-2022 zijn er voor het eerst wilde zoogdieren besmet geraakt. Waarschijnlijk doordat zij dode of zieke wilde vogels hebben gegeten die besmet waren met HPAI H5N1 virus. Dit nieuwe virus heeft dus het vermogen verkregen om zoogdieren te infecteren, want infecties van zoogdieren werden tijdens eerdere vogelgriep uitbraken niet gezien. Het is daarom van belang om de genetische samenstelling van de virussen uit zoogdieren te analyseren: hoe zijn deze virussen verwant zijn aan wilde vogelvirussen, en hebben deze virussen bepaalde genetische kenmerken? Daarnaast is het van belang om de virussen te analyseren op het ontstaan van zoönotische mutaties, die het risico voor de mens kunnen vergroten. In een zieke vos werd eerder dit jaar een zoönotische mutatie aangetoond, een aanpassing aan virusvermenigvuldiging in zoogdieren. Er zijn meer mutaties nodig voordat het virus zich kan verspreiden tussen zoogdieren/mensen, maar het risico van dit virus voor de mens (ook een zoogdier) toegenomen. Het is van belang om deze mutaties goed te monitoren om het risico voor de volksgezondheid goed te kunnen inschatten.