Project
GenTORE
De doelstelling van GenTORE is het verkrijgen van fundamentele kennis en het ontwikkelen van (genetisch en niet-genetische) tools, die het mogelijk maken om resilience en efficiëntie (R&E) van rundvee te verbeteren onder een uiteenlopende range van veehouderijomstandigheden.
Om dit te bereiken combineert GenTORE:
- multidisciplinaire wetenschappelijke expertise in genomics, life cycle assessment, voedingsfysiologie, diergezondheid, precision livestock farming, wiskundige modelering, en socio-economics;
- partners en stakeholders die fokkerijorganisaties, technologie bedrijven, adviesorganisaties, en de verschillende sectoren (conventioneel, organic, weidesysteem, etc. vetergenwoordigen); en
- unieke data (genotypes, fenotypes en sensor data).
De Nederlandse partners focussen op de volgende twee activiteiten: Big Data en genomic prediction. The Big Data activiteiten ontwikkelen proxies om R&E te kunnen bepalen op individueel dier en bedrijfsniveau, door
- het combineren van data van geautomatiseerde on-farm technologieën en nationale databases;
- gebruik nieuwe technologieën (drones) om dieren te fenotyperen in free range systemen, en
- om praktische precision tools te ontwikkelen die dieren ranken op verwachte levensproductie en resilience.
Genomic prediction tools voor R&E worden ontwikkeld die rekening houden met de omgeving waar het dier zich in bevind en het multi-trait aspect dat data voor productie- en voergebruik gecombineerd wordt.
Publicaties
-
Developing proxies for resilience and efficiency with at-market sensor technologies
-
Comparing regression, naive Bayes, and random forest methods in the prediction of individual survival to second lactation in Holstein cattle
Journal of Dairy Science (2019), Volume: 102, Issue: 10 - ISSN 0022-0302 - p. 9409-9421. -
Genomic models considering G×E: modelling heterogeneous SNP variances
In: Book of Abstracts of the 71th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (Book of abstracts No. 26 (2020)) - Wageningen Academic Publishers - ISBN: 9789086863495 - p. 192-192. -
Genomic models considering GxE: modelling heterogeneous SNP variances
-
Quantifying resilience of dairy cows from on-farm time-series measures
In: Book of Abstracts of the 71th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (Book of abstracts No. 26 (2020)) - Wageningen Academic Publishers - ISBN: 9789086863495 - p. 278-278. -
Between-herd variation in cow resilience
-
Predicting survival in dairy cattle by combining genomic breeding values and phenotypic information
Journal of Dairy Science (2020), Volume: 103, Issue: 1 - ISSN 0022-0302 - p. 556-571. -
Opportunities and challenges for livestock sensors
-
Modelling GxE to find efficient, robust and resilient cattle
In: Book of Abstracts of the 72nd Annual Meeting of the European Federation of Animal Science - Wageningen: Wageningen Academic Publishers - ISBN: 9789086863662 - p. 274-274. -
Validation of resilience indicators for dairy cattle based on milk yield data