Genetische variatie in het pangenoom van sla

Sla is een belangrijke en waardevolle bladgroente die veel morfologische en genetische variatie vertoont. Om een vertekend beeld door het gebruik van een “referentie” cultivar te voorkomen hebben we een pangenoom nodig om alle genetische variatie in kaart te brengen. Een pangenoom integreert genetische variatie over cultivar- en soortsgrenzen heen op zo’n manier dat andere genoomdata ermee vergeleken kan worden. In dit proefschrift dragen we bij aan dit holistisch begrip van genetische variatie in sla en haar verwanten door nieuwe geannoteerde genomen voor wilde verwanten van sla te bouwen, nieuwe methoden voor het bouwen en analyseren van grote plantpangenomen te ontwikkelen en het analyseren van een sla-pangenoom over soortsgrenzen heen. We hebben variaties in genen en genorganisatie gevonden die relevant zijn voor slaveredeling. Bovendien hebben we bijgedragen aan baanbrekende methodologie voor pangenomics die nodig is voor “genomics-based” plantveredeling in sla en andere gewassen.