Op zoek naar de Achilles’ hiel van Streptococcus suis. De onderliggende moleculaire mechanismes voor aanpassing aan de gastheer

Dit proefschrift onderzoekt hoe Streptococcus suis zich aanpast aan omstandigheden in de gastheer en identificeert kwetsbaarheden van S. suis die kunnen bijdragen aan de ontwikkeling van nieuwe antimicrobiële strategieën. Met behulp van transposonmutagenese en gastheer-afgeleide vloeistoffen identificeerden we conditioneel essentiële genen die nodig zijn voor groei in geactiveerd varkensserum en hersenvocht. Deze analyses lieten belangrijke rollen zien voor purinesynthese, membraanstabiliteit en aminozuurtransport. Vervolgens onderzochten we de reactie van S. suis op membraanstress en onthulden we een gecoördineerd regulatienetwerk dat het LiaFSR-systeem en twee LytTR-systemen omvat en dat de membraanintegriteit, competentie, biofilmvorming en levensvatbaarheid aanstuurt. De epigenetische regulatie werd bestudeerd via twee type I restrictie-modificatiesystemen, waarbij interacties tussen MS1 en MS2 koolhydraatinname, centraal metabolisme en groei beïnvloeden, vooral in ziekte-geassocieerde stammen. Daarnaast evalueerden we Nanopore sequencing voor toepassingen die nauwkeurige taxonomische en genetische resolutie vereisen en verbeterden we workflows voor het genereren en analyseren van lange reads. Gezamenlijk onthullen deze bevindingen metabole en regulatoire knelpunten die de overleving van S. suis in gastheerniches bepalen en bieden ze nieuwe aangrijpingspunten voor antimicrobiële interventies.