Genomics faciliteit - Long-read en short-read DNA-sequencing
Over deze faciliteit
In het kort- Combineert long- en short-read-sequencing.
- Vereist DNA van hoge kwaliteit.
- Geschikt voor complexe genomen.
Deze faciliteit biedt nauwkeurige en schaalbare DNA-sequencing voor complexe genomen, transcriptomen, metagenomen, amplicons en populaties. Ideaal voor onderzoekers en bedrijven die hoogwaardige data nodig hebben voor geavanceerd genomics- en veredelingsonderzoek.
Wat kun je doen bij deze faciliteit?
Met PacBio en Aviti biedt deze faciliteit een complete sequencing-infrastructuur voor zowel long-read- als short-readtoepassingen. Daarmee kunnen partners werken aan de-novo genoomassemblages, structurele variatieanalyse, full-length-transcriptoomonderzoek, populatie-resequencing en metagenomics.
Onze experts verzorgen monstervoorbewerking, library-preparatie en bio-informatica-analyse. Dankzij hoge datanauwkeurigheid, schaalbaarheid en uitgebreide multiplexingopties kunnen projecten van elk formaat efficiënt worden uitgevoerd.
High-quality long reads voor complexe genomen
Toepassingen:
- De novo genoomassemblage
- Detectie van structurele variatie
- Haplotype phasing
- Full-length-transcriptoom sequencing (Iso-Seq)
- Detectie van DNA-methylatie in natief DNA
Toepassingen:
- Populatiebrede genoomresequencing
- Transcriptoomsequencing
- Metagenomics
- Detectie van zeldzame mutanten
Voor wie is deze faciliteit bedoeld?
Deze faciliteit is geschikt voor interne en externe onderzoekers, veredelingsbedrijven, biotechbedrijven en organisaties die werken aan genoomonderzoek, variatieanalyse, transcriptoomstudies, metagenomics en innovatie.
“De combinatie van PacBio en Aviti geeft onderzoekers de vrijheid om elk genomics-project op de beste manier uit te voeren – van complexe genoomassemblages tot grootschalige populatiestudies.”
- Elio Schijlen
- Onderzoeker genetica
Waarom kiezen voor deze faciliteit?
Wij bieden:
- Zeer nauwkeurige HiFi-reads (>99.9% correcte base calling)
- Long-read sequencing zonder PCR amplificatievertekening
- Tot 100 Gb output per flowcel
- Ondersteunt multiplexing van meerdere monsters
- Ideaal voor de-novo genome assemblies, structurele genoom variatie- en full-length-transcriptoom analyse
Vragen over deze faciliteit?
Neem contact op voor beschikbaarheid, prijzen en toepassingsondersteuning.
dr. EGWM (Elio) Schijlen
Onderzoeker genetica