Verbetering van Noordzee biodiversiteitsmonitoring met behulp van nieuwe moleculaire methoden

De Noordzee is een productieve zee met een rijke flora en fauna, maar staat onder toenemende druk van de visserij en offshore industrieontwikkeling. Om de effecten hiervan te begrijpen, is frequente, nauwkeurige, efficiënte en schaalbare biodiversiteitsmonitoring nodig. Deze thesis onderzoekt hoe metabarcoding met omgevings-DNA (eDNA) de biodiversiteitsmonitoring van vissen en ongewervelden kan verbeteren ter ondersteuning van natuurbeheer in de Noordzee. Voor dit onderzoek werden nieuwe moleculaire methoden ontwikkeld met behulp van Oxford Nanopore-sequencing en getest in natuurlijke biogene riffen, scheepswrakken en offshore-windparken. Het onderzoek toont aan dat Nanopore-metabarcoding vergelijkbare resultaten oplevert als conventionele DNA-methoden, terwijl langere DNA-fragmenten en RNA extra inzicht bieden door betere soortidentificatie en een nauwkeuriger beeld van gemeenschappen. Biomonitoring met eDNA van natuurlijke schelpdierriffen toonde ook aan dat deze riffen rijkere visgemeenschappen herbergen, waaronder commercieel belangrijke soorten. Deze thesis laat zien dat geavanceerde DNA-gebaseerde technieken een veelbelovende, niet-invasieve monitoringmethode zijn voor de verbetering van marien beheer en besluitvorming.